Bio:: MCPrimers is een module Perl om moleculaire het klonen PCR inleidingsparen voor een bepaald gen tot stand te brengen zodat het gen gericht in een vector kan worden opgenomen. Solver is generisch, worden de beperkingsenzymen en hun orde in de vector gespecificeerd in de bezoeker.

SUBROUTINES XPORT

sub find_mc_primers
$orf, # koord ATGC (gebruik van I 21 NT stroomopwaarts, 200 NT downsteam)
$flag_hr, # anonieme knoeiboelverwijzing naar vlaggen van mcprimers.pl
$pr3_hr, # knoeiboelverwijzing naar Het dossiermarkeringen van de primer3- Kei
$ecut_loc_ar, # de verwijzing van de de plaatsserie van de enzymbesnoeiing van bezoeker
$vcut_loc_ar, # vector de serieverwijzing van de besnoeiingsplaats van bezoeker
@re # serie van de koorden van het beperkingsenzym van bezoeker
Niet explicitily uitgevoerd. Gebruik Bio:: MCPrimers:: find_mc_primers
Zie mcprimers.pl bij een voorbeeld van gebruik en voorkant.

INSTALLATIE

MCPrimers.pm - Plaats in de Lib/Bio/MCPrimers.pm
CloningVector.pm - Plaats in de Lib/Bio/Gegevens/Plasmide/CloningVector.pm
Vector dossiers - maak vectordossierfolder toegankelijk
mcprimers.pl - plaats in een folder waar het kan worden betreden
mcprimers_gui.pl - plaats in een folder waar het kan worden betreden
mcprimers.acd - breng acd folder voor EMBOSS aan
Slechts gecontroleerd met acdvalidate

MCPrimers_manual.doc - Gebruikersdocumentatie

MCPRIMER_DIR - plaats deze milieuvariabele om aan te richten
folder die mcprimers.pl bevatten
PRIMER3_DIR - Vastgestelde milieuvariabele om aan Primer3 te richten
uitvoerbare folder.

MSWindows - gebruik primer3.exe
Andere - gebruik primer3_core